1. Органы общей компетенции, защищающие интересы флота Федерального агентства по рыболовству за рубежом.
2. Защите прав и интересов промыслового флота России.
2.1. Органы специальной компетенции по защите интересов промыслового флота России.
2.2. Совместные комиссии по урегулированию претензий по рыболовству с Канадой, Японией, США и другими государствами.
2.3. Деятельность комиссии по урегулированию претензий по рыболовству.
2.4. Урегулирование споров, связанных с хозяйственной деятельностью государственных организаций и частных компаний в экономических зонах.